Prof. Dr. JÚLIO CÉSAR BORGES

Foto Docente

Histórico

Possui graduação em Farmácia pela Faculdade de Farmácia da Universidade Federal de Minas Gerais - UFMG (1996-1999) - e Doutorado em Biologia Funcional e Molecular com ênfase em Bioquímica pelo Instituto de Biologia da Universidade Estadual de Campinas - IB/UNICAMP (2000-2004). A parte experimental do projeto de pesquisa de doutorado foi desenvolvido nas dependências do então Centro de Biologia Molecular Estrutural do Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, em Campinas - CBME/LNLS/Campinas, atual Laboratório Nacional de Biociências do Centro Nacional de Pesquisas em Energia e Materiais (LNBio/CNPEM/Campinas). Realizou pós-doutoramento no Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas - IBILCE/UNESP (2005-2006) e no CBME/LNLS/Campinas (2006-2007). Possui Livre-Docência pelo Instituto de Química de São Carlos da Universidade de São Paulo - IQSC/USP (2015) na área de concentração de Bioquímica. Atualmente é Professor Associado (MS5.1) do IQSC/USP responsável pelas disciplinas de Bioquímica e Biofísica de proteínas na graduação e pós-graduação. É orientador credenciado de mestrado e doutorado do programa de pós-graduação em Química do IQSC/USP e no programa de pós-graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular da Universidade Federal de São Carlos. Tem experiência na área de Bioquímica, com ênfase em Biologia Molecular, Biologia Estrutural e Biofísica de Proteínas. Atua principalmente nos seguintes temas: Expressão Heteróloga de Proteínas, Proteínas em solução, Chaperones moleculares, Hsp70, Hsp90, Dicroísmo circular, Fluorescência, Calorimetria e Ultracentrifugação Analítica.


Linhas de Pesquisa

A linha de pesquisa estabelecida no IQSC envolve a aplicação de técnicas de biologia molecular para clonar DNAs codificadores de proteínas de interesse para a expressão destas em sistemas heterólogos e purificação para posterior caracterização funcional e estrutural. As proteínas produzidas são caracterizadas experimentalmente por técnicas bioquímicas (cromatografia, eletroforese de proteínas, cinética enzimática, ELISA e Western blot), espectroscópicas (dicroísmo circular e fluorescência), termodinâmicas (calorimetria de titulação isotérmica, calorimetria de varredura diferencial e ultracentrifugação analítica) e estruturais (espalhamento de raios X a baixos ângulos – SAXS, modelagem molecular por homologia, ultracentrifugação analítica), entre outras. Estratégias experimentais explorando a estabilidade térmica e química, também são utilizadas para a obtenção de informações sobre a organização estrutural da proteína e de seus domínios. O objetivo destes experimentos é caracterizar os fatores determinantes e as mudanças conformacionais importantes para a relação estrutura-função de chaperonas moleculares humanas, de levedura e de protozoários causadores de doenças negligenciadas como malária e leshmaniose. As principais famílias de chaperonas moleculares em estudo são as Hsp90 e Hsp70 incluindo muitas de suas co-chaperonas. A interação entre as proteínas de interesse com ligantes (pequenas moléculas, ligantes naturais, inibidores, outras proteínas, etc) é estudada por várias estratégias, especialmente por fluorescência, calorimetria de titulação isotérmica, ELISA e SAXS.
Utilizando técnicas bioquímicas e proteômicas (Western blot, eletroforese bidimensional e espectrometria de massas) estuda-se a expressão diferencial de proteínas de interesse em protozoários e a também a interação proteína-proteína. O estudo da expressão diferencial de proteínas em culturas de células submetidas ao tratamento com fármacos de interesse inibidores das Hsp90 é um dos objetivos de estudo desta abordagem. Identificação de novos (ou seletivos) ligantes das Hsp90 e Hsp70 também é pretendida através de abordagens experimentais de deslocamento térmico e ELISA.


Publicações

- DORES-SILVA, P.R.; BELOTI, L.L.; MINARI, K.; SILVA, S.M.O., BARBOSA, L.R.S.; BORGES, J.C. Structural and functional studies of Hsp70-escort protein – Hep1 – of Leishmania braziliensis. International Journal of Biological Macromolecules, 2015.
- BATISTA, F.A. H.; GAVA, L.M.; PINHEIRO, G.M.S.; RAMOS, C.H.I.; BORGES, J.C. From conformation to interaction: techniques to explore the Hsp70/Hsp90 network. Current Protein and Peptide Science, 2015.
- SERAPHIM, T.V.; GAVA, L.M.; MOKRY, D.Z.; CAGLIARI, T.C.; BARBOSA, L.R.S.; RAMOS, C.H.I.; BORGES, J.C. The C-terminal region of the human p23 chaperone modulates its structure and function. Archives of Biochemistry and Biophysics, v. 565, p. 57-67, 2015.
- DORES-SILVA, P.R.; BARBOSA, L.R.S.; RAMOS, C.H.I.; BORGES, J.C. Human Mitochondrial Hsp70 (Mortalin): Shedding Light on ATPase Activity, Interaction with Adenosine Nucleotides, Solution Structure and Domain Organization. PLoS One, v. 10, p. e0117170, 2015.
- BATISTA, F.A.H.; ALMEIDA, G.S.; SERAPHIM, T.V.; SILVA, K.P.; MURTA, S.M.F.; BARBOSA, L.R.S.; BORGES, J.C. Identification of two p23 co-chaperone isoforms in Leishmania braziliensis which exhibit similar structures and Hsp90 interaction properties despite divergent stabilities. The FEBS Journal, v. 282, p.388-406, 2015.
- ARAUJO, T.L.S.; BORGES, J.C.; RAMOS, C.H.I.; MEYER-FERNANDES, J.R.; OLIVEIRA JÚNIOR, R.S.; PASCUTTI, P.G.; FOGUEL, D.; PALHANO, F.L. Conformational Changes in Human Hsp70 Induced by High Hydrostatic Pressure Produce Oligomers with ATPase Activity but without Chaperone Activity. Biochemistry, v. 53, p. 2884-2889, 2014.
- MURAKAMI, M.T.; RODRIGUES, N.C.; GAVA, L.M.; HONORATO, R.V.; CANDURI, F.; BARBOSA, L.R.S.; OLIVA, G.; BORGES, J.C. Structural studies of the Trypanosoma cruzi Old Yellow Enzyme: Insights into enzyme dynamics and specificity. Biophysical Chemistry, v. 184, p. 44-53, 2013.
- SERAPHIM, T.V.; SILVA, I.M.; GOMES, F.E.R.; SILVA, K.P.; BARBOSA, L.R.S.; BORGES, J.C. Low resolution structural studies indicate that the Activator of Hsp90 ATPase 1 (Aha1) of Leishmania braziliensis has an elongated shape which allows its interaction with both N- and M-domains of Hsp90. PLos One, 8(6), e66822, 2013.
- DORES-SILVA, P.R.; MINARI, K.; RAMOS, C.H.I.; BARBOSA, L. R. S.; BORGES, J.C. Structural and stability studies of the human mtHsp70-escort protein 1: an essential mortalin co-chaperone. International Journal of Biological Macromolecules, 2013. 56, p. 140-148, 2013.
- SILVA K.P.; SERAPHIM T.V.; BORGES, J.C. Structural and functional studies of Leishmania braziliensis Hsp90. BBA – Protein and Proteomics, 834, p. 351-361, 2013.
- BORGES, J.C.; SERAPHIM, T.V.; MOKRY, D.Z.; ALMEIDA, F.C.L.; CYR, D.M.; RAMOS, C.H.I. Identification of regions involved with substrate binding and dimer stabilization within the central domains of Yeast Hsp40 Sis1. PLOS One, 7, e50927, 2012.
- DORES-SILVA, P.R., SILVA, E.R; GOMES, F.E.R.; SILVA K.P.; BARBOSA, L.R.S.; BORGES, J.C. Low resolution structural characterization of the Hsp70-interacting protein – Hip – from Leishmania braziliensis emphasizes its high asymmetry. Arch. Biochem. Biophys. 2012. v. 520, p. 88-98.
- SILVA, K.P.; BORGES, J.C. The Molecular Chaperone Hsp70 Family Members Function by a Bidirectional Heterotrophic Allosteric Mechanism. Protein Pept. Lett., 2011. v. 18, p. 132-142.
- BORGES, J.C.; RAMOS, C.H.I. Analysis of molecular targets of Mycobacterium tuberculosis by analytical ultracentrifugation. Curr. Med. Chem., 2011, 18: 1276-1285.
- SILVA, J.C.; BORGES, J.C.; CYR, D.M.; RAMOS, C.H.I.; TORRIANI, I. Central domain deletion affects the structure and function of Sis1 and Ydj1 Hsp40s. BMC Struct. Biol. v. 11, p. 40, 2011.
- GAVA, L.M.; GONÇALVES, D. C.; BORGES, J.C.; RAMOS, C.H.I. Stoichiometry and thermodynamics of the interaction between the C-terminus of human 90 kDa heat shock protein Hsp90 and the mitochondrial translocase of outer membrane Tom70. Arch. Biochem. Biophys., 2011. 513, 119-125.
- LIBARDI, S.H.; BORGES, J.C.; SKIBSTED, L.H.; CARDOSO, D.R. Deactivation of Ferrylmyoglobin by Vanillin as Affected by Vanillin Binding to β-Lactoglobulin. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2011. 59 (11), 6202–6208.
- CARVALHO, F.A.O., SANTIAGO, P.S., BORGES, J.C., TABAK, M. (2011) Molecular masses and sedimentation coefficients of extracellular hemoglobin of Glossoscolex paulistus: Alkaline oligomeric dissociation. International Journal of Biological Macromolecules, 48, 183-193.
- CAGLIARI, T.C.; SILVA, V.C.H.; BORGES, J.C.; PRANDO, A.; TASIC, L.; RAMOS, C.H.I. Sugarcane Hsp101 is a hexameric chaperone that binds nucleotides. International Journal of Biological Macromolecules. 2011. 49, 1022-1030.
- GONÇALVES, K.A., BORGES, J.C., SILVA, J.C.; PAPA, P.F.; BRESSAN, G.C.; TRORRIANI, I.; KOBARG, J. Solution structure of the human signaling protein RACK1. BMC Struc. Biol. 2010. v. 10, p. 15,
- BORGES, J.C.; RAMOS, C.H.I. Characterization of nucleotide-induced changes on the structure of human 70 kDa heat shock protein Hsp70.1 by analytical ultracentrifugation. BMB Reports, v. 42, p. 166-171, 2009.
- CARVALHO, F.A.O.; SANTIAGO, P.S.; BORGES, J.C.; TABAK, M. On the molecular mass of the extracellular hemoglobin of Glossoscolex paulistus: analytical ultracentrifugation re-examination. Analytical Biochemistry (Print), v. 385, p. 257-263, 2009 – doi:10.1016/j.ab.2008.11.008.
- BRESSAN, G.C.; SILVA, J.C.; BORGES, J.C.; PASSOS, D.O.; RAMOS, C.H.I.; TORRIANI, I.; KOBARG, J. The human regulatory protein KI-1/57 has characteristics of an intrinsically unstructured protein. Journal of Proteome Research, v. 7, p. 4465-4474, 2008.
- ARCURI, H.A.; BORGES, J.C.; FONSECA, I.O.; PEREIRA, J.H.; RUGGIERO NETO, J.; BASSO, L.A.; SANTOS, D.S.; AZEVEDO JUNIOR, W.F. Structural studies of shikimate 5-dehydrogenase from Mycobacterium tuberculosis. Proteins, v. 72, p. 720-730, 2008.
- VIVAN, A.L.; CACERES, R.A.; ABREGO, J.R.B.; BORGES, J.C.; RUGGIERO NETO, J.; RAMOS, C.H.I.; AZEVEDO JUNIOR, W.F.; BASSO, L.A.; SANTOS, D.S. Structural studies of prephenate dehydratase from H37Rv by SAXS, ultracentrifugation, and computational analysis. Proteins, v. 72, p. 1352-1362, 2008.


Pessoal